UBND tỉnh giao Sở Giáo dục và Đào tạo chủ trì, phối hợp với UBND các huyện, thành phố và các cơ quan, đơn vị có liên quan xây dựng kế hoạch và dự toán kinh phí thực hiện Chương trình; phương án phân bổ phân bổ dự toán toán kinh phí Chương trình, đảm bảo tuân thủ theo đúng trình tự, thủ tục quy định hiện hành, hướng dẫn của Bộ Giáo dục và Đào tạo và mục tiêu, nhiệm vụ của Chương trình gửi Sở Tài chính, Sở Kế hoạch và Đầu tư để thẩm định.
Căn cứ Quyết định số 2248/QĐ-BTC ngày 28/11/2018 của Bộ Tài chính về việc bổ sung có mục tiêu từ ngân sách trung ương cho ngân sách địa phương kinh phí sự nghiệp thực hiện Chương trình mục tiêu giáo dục vùng núi, vùng dân tộc thiểu số, vùng khó khăn năm 2018; Công văn số 5288/BGDDT-KHTC ngày 22/11/2018 của Bộ Giáo dục và Đào tạo về việc triển khai Chương trình mục tiêu giáo dục vùng núi, vùng dân tộc thiểu số, vùng khó khăn giai đoạn 2016-2020.
Sau khi xem xét, UBND tỉnh giao Sở Giáo dục và Đào tạo chủ trì, phối hợp với UBND các huyện, thành phố và các cơ quan, đơn vị có liên quan xây dựng kế hoạch và dự toán kinh phí thực hiện Chương trình; phương án phân bổ phân bổ dự toán toán kinh phí Chương trình, đảm bảo tuân thủ theo đúng trình tự, thủ tục quy định hiện hành, hướng dẫn của Bộ Giáo dục và Đào tạo và mục tiêu, nhiệm vụ của Chương trình gửi Sở Tài chính, Sở Kế hoạch và Đầu tư để thẩm định.
Giao Sở Tài chính chủ trì, phối hợp với Sở Kế hoạch và Đầu tư trên cơ sở đề xuất của Sở Giáo dục và Đào tạo, có trách nhiệm thẩm định kế hoạch dự toán và phương án phân bổ kinh phí thực hiện Chương trình, báo cáo UBND tỉnh xem xét, quyết định.